O výrobě počítačů IBM PC kompatibilní pro profesionální použití začala Atari uvažovat v roce 1986 a donutila ji k tomu samozřejmě situace na trhu, kde již PC začaly dominovat. Ale nebylo to poprvé, co se IBM PC staly u Atari předmětem zájmu - Atari zvažovala IBM PC kompatibilní počítač již v roce 1983 (ještě za Atari Inc.), kdy zahájila práce na počítači Atari 1600XL a 1650XLD. Podle konstruktérů to měly být hybridy s osmibitovým mikroprocesorem MOS 6502 a šestnáctibitovým Intelem 80186, které mohly pracovat buď v režimu 6502 nebo v režimu IBM kompatibilní. Oba tyto projekty nebyly nikdy dokončeny.
Koncem roku 1987 Atari oznámila roční obrat 493 miliónů USD, se ziskem 57 miliónů. V srpnu stejného roku také koupila za 67 miliónů USD společnost Federated Group of Electronics Stores - obchodní řetězec 67 obchodů s elektronikou a téměř třemi tisíci zaměstnanci, kde plánovala prodávat své výrobky, včetně PC. Nejmladší Tramielův syn, Garry (27), se tam zanedlouho stal prezidentem. (Atari si řetězec udržela ale jen do roku 1989 - pak byl prodán dále.)
První skutečně IBM PC kompatibilní počítače začala Atari vyrábět počátkem roku 1987. Prvním byl model Atari PC-1, který představoval, jak bylo u Atari zvykem, vlastní uzavřenou konstrukci. Měl sice lepší parametry než obdobné konkurenční IBM PC XT, avšak byl komplikovanější a dražší - tudíž se neprodával příliš dobře. Uzavřená konstrukce byla pro uživatele velkým nedostatkem. Navíc se zde podepsal špatný marketing Atari, takže veřejnost ani moc nevěděla, že Atari vyrábí nějaké stolní PC systémy. Představen byl na Hannoverském veletrhu spotřební elektroniky a mikroelektroniky 1987.
Počítač Atari PC-1 měl mikroprocesor Intel 8088-2 na přepínatelném taktu 4.77 nebo 8 MHz, paměť RAM 512 KB s možností přidat 256 KB Video-RAM, ROM 32 KB, pevný disk až 60 MB, vestavěnou disketovou jednotku 360 KB 5.25", podporu CGA, EGA a Herkules monitorů a paletu 64 barev. Klávesnice byla připojena spirálovým kabelem, byla typu XT a tudíž měla 84 kláves. Operační systém byl samozřejmě MS-DOS - přesněji verze MS-DOS 3.2. Sériové byl dodáván 12" EGA monochromatický monitor PCM 124.
Další PC Atari (PC-2 až PC-5) již byly z klasických komponent montované typy, které se však nikdy výrazně neprosadily a snad kromě loga ani nezaujaly.
Jedinou výjimkou populárního Atari PC byl kapesní šestnáctibitový personální počítač Atari Portfolio, představený na Atari Messe 89' v německém Düsseldorfu a vyráběný v letech 1989 až 1994, jehož licenci zakoupila Atari od společnosti Distributed Information Procesing (DIP) z anglického Guildfordu. Atari Portfolio Palmtop byl kapesní PC s mikroprocesorem Intel 80C88 (CMOS verze), pamětí RAM 128 KB (šla rozšířit až na 640 KB), paměť ROM 256 KB (obsahovala OS a několik kancelářských programů), operačním systémem DIP-OS 2.11 (shodným s MS-DOS 2.11, neměl pouze externí příkazy) a vestavěným monochromatickým LCD displejem s rozlišením 260x64 bodů.
Přístroj byl zhruba o velikosti VHS videokazety a s hmotností 500 gramů. Byl to první počítač z kategorie nazvané později jako "kapesní počítače, kapesní laptop". Neměl žádný pevný disk a data šlo ukládat pouze na externí paměťové RAM karty v creditcart formátu o kapacitě 32, 64 a 128 KB. Napájení bylo z baterií nebo z externího 6V adaptéru. Prodejní cena byla navržena na 700 DEM. Z originálního příslušenství byli dostupné: moduly rozšiřujících pamětí, sériové a paralelní rozhraní, čtečka karet. Další doplňky pro Portfolio pocházely od třetích firem.
Jako zajímavost lze uvést, že právě tento přístroj používal mladý John Connor ve filmu Terminátor II (1991).